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JSTと産総研CBRC、東工大、理研IMS、超高速アルゴリズムでP値を高精度に、乳がん転写因子の新組み合わせを�
from 日経バイオテクONLINE
(2013-7-23 4:00)
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科学技術振興機構（JST）戦略的創造研究推進事業ERATO型研究「湊離散構造処理系プロジェクト」のグループリーダーを務めている産業技術総合研究所生命情報工学研究センター（CBRC）の津田宏治主任研究員と東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻の瀬々潤准教授、理化学研究所統合生命医科学研究センター（IMS）の岡田眞里子チームリーダーらは、超高速アルゴリズムの技法を用いて従来に比べ格段に高い精度で誤発見の確率を示す検定値（P値）を計算するアルゴリズム（手順）を開発した。この手法を、乳がん細胞株の増殖・分化に関与している転写因子の研究に利用したところ、既存の遺伝子発現データから新たな組み合わせ因子を発見できた。この成果は、米科学アカデミー紀要（PNAS誌、インパクトファクター9.737）のオンライン速報版で2013年7月22日の週に公開される。
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東工大と遺伝研、東大など、シーラカンス5頭ゲノム解読を発表、アセンブラーPLATANUS活用ゲノム解読の初論�
from 日経バイオテクONLINE
(2013-7-23 0:00)
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東京工業大学大学院生命理工学研究科と情報・システム研究機構国立遺伝学研究所、東京大学大学院新領域創成科学研究科などの共同研究グループは、生きた化石と呼ばれる希少種シーラカンス5頭について全ゲノム配列（約27億塩基対）を決定して、大規模な比較ゲノム解析を実施した成果を、米Genome Research誌（インパクトファクター14.397）で2013年7月22日に発表した。7月22日に都内で開催された記者会見では、東工大の岡田典弘名誉教授と二階堂雅人助教、梶谷嶺大学院生（D2）、遺伝研の小原雄治特任教授/ライフサイエンス統合データベースセンター長、藤山秋佐夫教授、豊田敦特任准教授、野口英樹特任准教授の合計7人が説明席に座った。この研究は、小原特任教授が代表を務める文部科学省科学研究費新学術領域研究「ゲノム支援」の支援を受けて進められた。
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Elevance Renewable Sciences社とWilmar International社、インドネシアにある世界規模のバイオリファイナ�
from 日経バイオテクONLINE
(2013-7-23 0:00)
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米Elevance Renewable Sciences社とシンガポールWilmar International社は2013年7月18日、インドネシアGresikにあるElevance-Wilmarジョイントベンチャーの最初の大規模バイオリファイナリーから、顧客向けに新規物質を含む再生可能な機能性スペシャルティー化学品製品の出荷を開始したと発表した。この合弁バイオリファイナリーはElevance社独自のメタセシス技術（metathesis technology）に基づいた最初のリファイナリーで、再生可能なスペシャルティー化学品、オレフィン、オレオケミカルなどを生産している。オレフィンメタセシス技術は2005年ノーベル化学賞を受賞した技術である
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参議院議員選挙／板橋区立教育科学館のロボット展示／富士山噴火は2,000年間で43回／研究者による科学コミ�
from 森山和道
(2013-7-22 23:27)
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Tweet ▼参議院議員選挙。
▼投票後、 夏休みのロボット展示が始まった板橋区立教育科学館 に行く。ちょうど、 ロボットショップ「ろぼとま」 による「チキチキロボットデスマッチ」が佳境で、思っていた以上に親子連れがいっぱい。和気あいあいと、ちょうどいいくらいの人数だった。
▼この手の試合も久しぶりに見たけど、良くも悪くも変わらない世界。久しぶりにお会いした方々ばかり。
▼Wakamaruはこの日はイベント中なので動かしてなかったが、前日は行列ができたとか。音声認識の精度にがっかりした子どもたちが少なくないんじゃないかと……。
▼東工大・広瀬研のロボットは静展示なので知ってる人は興味深そうに見てる感じ。ふだんはモニターで動いてる様子のビデオを流してるそうだが、イベント中は別の用途に使われていて、がっかりしてる子どもがいたのはちょっとかわいそう。
▼「大人の科学」のふろくはふつうに人気で、子供たちがうちわであおぎまくって「リノセロス」を歩かせたりしていた。
大人の科学マガジン別冊 テオ・ヤンセンのミニ・リノセロス (学研ムック大人の科学マガジンシリーズ)
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Wmの憂鬱、梅雨空の仙台から【日経バイオテクONLINE Vol.1911】
from 日経バイオテクONLINE
(2013-7-22 20:00)
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現在、梅雨が明けない仙台で取材中です。
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東大と東海大、京大、金沢大、ブレオマイシン誘導性肺線維症で線維芽細胞は質的に変化、次世代シーケンサー
from 日経バイオテクONLINE
(2013-7-22 19:00)
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東京大学医学系研究科の津久井達哉・日本学術振興会特別研究員、上羽悟史講師、松島綱治教授らは、肺線維症をもたらす活性化線維芽細胞が病変部位に集積するメカニズムの一端を解明し、2013年7月22日に米The American Journal of Pathology誌（インパクトファクター4.522）のオンライン速報版で発表した。科学技術振興機構（JST）課題達成型基礎研究の一環で、東海大学の稲垣豊教授、京都大学の戸村道夫准教授、金沢大学の橋本真一特任教授らと共同研究の成果だ。
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ゼネラルヘルスケアがOA総合誌SPPの論文募集開始、査読委員400人、APC900ドル
from 日経バイオテクONLINE
(2013-7-22 18:00)
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ゼネラルヘルスケア（東京・港、竹澤慎一郎代表取締役）は、2013年秋に創刊する予定であるオープンアクセス（OA）学術論文誌「Science Postprint（SPP）」の論文募集を2013年7月22日に開始した。「Research Article」「Clinical Trial」の2種類の研究論文に加え、特定分野のホットトピックスを概説する「Review Article」も募集している。OA誌は、誰もが無料で論文全文を閲覧できるので読者からの購読収入は無い。ジャーナル発行に必要な費用の多くは論文投稿者が論文出版加工料（APC）として負担する。APC費用は一般的に2000ドル前後より高額に設定されていることが多いのに比べ、SPPではAPC費用を900ドル/13万5000円と安めに設定した。
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抗がん剤を開発する米Onyx Pharmaceuticals社の買収の行方はいかに
from 日経バイオテクONLINE
(2013-7-22 7:50)
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米Onyx Pharmaceuticals社は2013年6月30日、「Onyx Pharmaceuticals Confirms Receipt of Unsolicited Acquisition Proposal from Amgen」という表題のニュースリリースを公表し、米Amgen社からの買収提案を拒否して、買い手候補を探すことを市場に発信した。このリリースの影響は大きく、同社の株価は1.5倍に跳ね上がった。
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アジア細胞治療学会、韓国Medipost社が世界初の他家MSC細胞医薬の現状を報告
from 日経バイオテクONLINE
(2013-7-22 2:28)
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韓国Medipost社のJay Lee取締役（写真左）は2013年7月18日、台湾で開催されたアジア細胞治療学会（ACTO）年次集会で、細胞医薬「Cartistem」の現状について報告した。
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【連載】ここが変だよ、日本のアカデミア（第8回）、「日本にイノベーション基盤を構築できるか（後編）」
from 日経バイオテクONLINE
(2013-7-22 0:45)
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世界がオープンアクセスに向けて動いている中、日本の動きは独特のものがある。
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